W listopadzie 1982 r., kiedy dr hab. Jacek J. Pietrzyk został kierownikiem I Kliniki Chorób Dzieci, Oddział Noworodkowy oficjalnie włączono w struktury I Kliniki jako Oddział Patologii Noworodka. W 1985 roku prof. Pietrzyk wyjechał do Stanów Zjednoczonych, m.in. w celu zapoznania się z organizacją pracy oddziałów noworodkowych. Owocem spotkań z amerykańskimi specjalistami, przede wszystkim z prof. George’em J. Peckhamem z Children’s Hospital of Philadelphia, były stopniowe przemiany w Oddziale Noworodkowym. W 1986 roku oddział został przeniesiony z tzw. przełączki na najniższym piętrze najstarszego budynku Instytutu Pediatrii na I piętro, do Oddziału III Niemowlęcego. Tam, staraniem prof. Pietrzyka, podczas budowy Centrum Ambulatoryjnego Leczenia Dzieci Instytutu Pediatrii, wygospodarowano część funduszy na remont, dzięki czemu stworzono nowy, 12-łóżkowy Oddział Patologii Noworodka. Ostatecznie w lutym 1990 roku, po remoncie i doposażeniu w sprzęt, otwarto 16-łóżkowy Oddział Intensywnej Terapii Noworodka. Pierwszymi lekarzami pracującymi w Oddziale, oprócz prof. Jacka J. Pietrzyka, byli: Zofia Mitkowska, Janina Lankosz-Lauterbach, Barbara Majerska, Marta Żygulska, Jacek Molicki, Ewa Starzycka, Małgorzata Klimek. Z czasem do zespołu dołączyli Marek Kania, Piotr Kruczek, Tomasz Tomasik, Beata Radzymińska, Przemko Kwinta. Początki funkcjonowania oddziału były trudne ze względu na brak specjalistycznego sprzętu. Unikatowym w skali kraju wydarzeniem było w 1991 roku zaimplementowanie do pracy oddziału amerykańskiej elektronicznej bazy danych – Neonatal Information System (NIS), pozwalającej na szczegółową rejestrację działań diagnostycznych i leczniczych, dającej możliwość obiektywnych porównań i analiz. W jej zakupie, a następnie wdrożeniu, pomagał również prof. George J. Peckham, a NIS, po licznych modyfikacjach, stał się autorską bazą danych, w której szczegółowo rejestrowany jest przebieg każdej hospitalizacji noworodka, a dane są aktualizowane codziennie, dzięki mrówczej pracy dwóch doświadczonych sekretarek medycznych. W ramach kontynuacji współpracy polsko-amerykańskiej, Klinikę odwiedzali, z wykładami i zajęciami o charakterze praktycznych warsztatów, profesorowie ze Stanów Zjednoczonych, a lekarze i pielęgniarki z Kliniki odbywali staże szkoleniowe w wiodących ośrodkach za oceanem: Children’s Hospital of Philadelphia − University of Pennsylvania, Boston Children’s Hospital − Harvard University, Kosair Children’s Hospital − University of Louisville oraz National Children’s Hospital, Washington DC. Przełomowym momentem dla działalności oddziału było wyposażenie go w karetkę reanimacyjną oraz uruchomienie profesjonalnego zespołu transportującego noworodki, w tym skrajnie niedojrzałe wcześniaki, ze szpitali makroregionu Polski południowej do Oddziału Patologii i Intensywnej Terapii Noworodka. Przy współpracy nieocenionego prof. Peckhama oraz amerykańskiej Fundacji Project HOPE, zorganizowano wizytę prof. Jacka Pietrzyka w ośrodkach polonijnych, m.in. w Nowym Jorku, Detroit, Chicago i Waszyngtonie. Efektem tej akcji było zgromadzenie funduszy, z których w 1995 roku zakupiono i wyposażono w noworodkowy panel transportowy nowoczesną karetkę marki Mercedes. Równocześnie stworzono wysokospecjalistyczny transport noworodkowy, pracujący w trybie całodobowym, co stanowiło przełom w opiece nad najmniejszymi pacjentami. Działania te przyczyniły się do znaczącej poprawy przeżywalności najciężej chorych noworodków z obszaru Polski południowo-wschodniej. Dzięki staraniom obecnego dyrektora Uniwersyteckiego Szpitala Dziecięcego, dr. hab. Macieja Kowalczyka oraz ówczesnego kierownika Kliniki Chorób Dzieci prof. Jacka J. Pietrzyka, a przede wszystkim Fundacji TVN „Nie jesteś sam”, w 2007 roku wybudowano i wyposażono nowoczesny, przestronny Oddział Patologii i Intensywnej Terapii Noworodka, pełniący funkcję oddziału o najwyższym, III stopniu referencyjności. Uroczyste otwarcie nowego oddziału odbyło się 11 kwietnia 2007 roku.