Do codziennej praktyki zostały wprowadzone nowe metody diagnostyczne układu oddechowego, jak bronchoskopia i spirometria. Dzieci z ostrymi i przewlekłymi chorobami płuc mogły się również leczyć w Poradni Pulmonologicznej. W latach 90. otwarto także pracownię fiberobronchoskopii oraz Poradnię Alergologiczną. Oddział stopniowo poszerzał zakres swoich medycznych zainteresowań. Obecnie funkcjonuje pod nazwą Oddział Pulmonologii, Alergologii i Dermatologii.